I årets løb aflyste Bornholmslinjen 40 afgange på grund af ekstremt vejrlig. I 24 af disse tilfælde blev sejladsen gennemført af en erstatningsfærge. Dertil kommer, at 128 afgange i januar 2021 blev annulleret, fordi Bornholmslinjen som følge af de svenske indrejserestriktioner fik tilladelse til at omlægge sejlplanen og begrænse antallet af sejladser til Ystad.
Mængden af aflysninger er lavere end alle foregående år. I 2020 måtte rederiet aflyse 114 afgange.
Størrelsen på boden, som Bornholmslinjen skal betale til Transportministeriet som straf, afhænger af forsinkelsen. 10-20 minutter koster 2.000 kroner, mens en sen ankomst på 1-2 timer resulterer i en bod på 18.000 kroner. Aflysninger og forsinkelser, der overstiger fire timer, takseres med den højeste bod på 60.000 kroner.